酶标仪具有功能强大的内部软件，有包括中文在内的多种界面语言可选。功能包括：设置微孔板布局(包括空白、标准品、待测样品、质控品等)，显示检测结果，进行数据处理(包括动力学分析，数据预处理，曲线拟合，数据分类，质控等)。此外，FC也可以使用功能强大的SkanIt软件进行仪器的控制和数据结果的处理。
酶标仪的主要检测项目
1.酶标仪在医疗行业的检测项目：
(1)过敏原：皮肤不耐受等；
(2)甲状腺：促甲状腺激素，T3T4等；
(3)糖尿病：C肽，胰岛素，胰岛素抗体，胰岛素原等；
(4)优生优育：弓形虫抗体，巨细胞病毒，风疹病毒等；
(4)不孕症：性激素六项，泌乳素，雌三醇，生长素，抗精子抗体等；
(5)传染病类：例如肝炎，艾滋病，衣原体，肺炎支原体，梅毒，水痘等；
(6)肿瘤标志物：癌胚抗原，甲胎蛋白，乳腺癌，卵巢癌，膀胱癌，胃肠癌等。
2.酶标仪在食品卫生，农业以及畜牧行业的检测项目：
(1)营养成分；
(2)添加剂；
(3)农药残留量；
(4)菌毒素；
(5)无机毒素；
(6)抗生素激素残留；
(7)致癌物质残留；
(8)有毒有害物质污染等。
